A existência de uma infra-estrutura de laboratórios associada a um corpo técnico de reconhecida competência na abordagem dos diferentes aspectos da questão ambiental, com ênfase na pesquisa aplicada e no desenvolvimento de novas tecnologias, qualifica o ITEP como uma instituição relevante para a implementação ações de Controle Ambiental.

Mais recentemente, estão sendo estruturadas novas linhas de trabalho relacionadas aos problemas ambientais do Semi-Árido (escassez de água, desertificação, contaminação de solos, etc) e dos grandes centros urbanos com as características específicas (estuários, favelas, áreas industriais, etc.).

A área de atuação Tecnologia Ambiental inclui os programas de Recursos Hídricos, Qualidade Ambiental e Engenharia Ambiental que têm como foco o apoio tecnológico para a implementação de políticas públicas de Recursos Hídricos e Qualidade Ambiental e a realização de pesquisas tecnológicas visando a solução de problemas ambientais.